Protein–RNA interactions for Protein: E9QAI8

Gm3460, Predicted gene 3460, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3460E9QAI8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3460E9QAI8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms