Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms