Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC051665E9Q623 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC051665E9Q623 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC051665E9Q623 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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