Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms