Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pdzd2E9Q1M1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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