Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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Zfp558E9Q1J0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zfp558E9Q1J0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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