Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms