Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3095E9Q058 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms