Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fndc1E9Q043 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fndc1E9Q043 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms