Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gcom1E9PZ54 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms