Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc8E9PWG2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc8E9PWG2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms