Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms