Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3bE9PUL3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms