Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms