Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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