Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc170D3YXL0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms