Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phf11bB4XVQ1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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