Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms