Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms