Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc2B2RR83 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms