Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms