Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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