Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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