Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem235B1AQL3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem235B1AQL3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms