Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfap221A9Q751 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfap221A9Q751 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms