Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skint7A7XV04 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms