Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms