Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Samt1A2BED8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Samt1A2BED8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Samt1A2BED8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Samt1A2BED8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms