Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms