Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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