Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms