Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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