Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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