Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Frmpd1A2AKB4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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