Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc163A2AGD7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc163A2AGD7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms