Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frmpd4A2AFR3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms