Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdc27A2A6Q5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms