Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Calcoco2A2A6M5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms