Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms