Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms