Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm17190V9GX38 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm17190V9GX38 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms