Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms