Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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