Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubl3Q9Z2M6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubl3Q9Z2M6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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