Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3Q9Z2D8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms