Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccne2Q9Z238 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms