Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn13Q9Z0S4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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