Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AireQ9Z0E3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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AireQ9Z0E3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AireQ9Z0E3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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