Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp4Q9WV89 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp4Q9WV89 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp4Q9WV89 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp4Q9WV89 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp4Q9WV89 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp4Q9WV89 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms