Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec2Q9WV35 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms